Critère : B2ab(ii,iii,iv,v)
Aponogeton eggersii est menacée par des impacts secondaires résultant de la dégradation ou de la destruction de l'habitat terrestre environnant en raison du déplacement de l'agriculture, de l'exploitation forestière et de la récolte du bois. Ces impacts comprennent: la perte d'ombre, la fluctuation des températures, la sédimentation, la modification de la qualité de l'eau, les impacts accrus des humains et du bétail au pâturage. L'espèce peut également être menacée de destruction et de perturbation résultant des activités de pêche dans les ruisseaux et rivières qu'elle habite.
L'espèce est une zone d'occupation de 18 km², ce qui représente deux localités. Il est soumis à un déclin continu de sa zone d'occupation et de la qualité de son habitat en raison d'effets secondaires liés à l'agriculture itinérante, à l'exploitation forestière et à la récolte du bois dans la zone terrestre environnante, ainsi qu'à la destruction et aux perturbations résultant des activités de pêche. Par conséquent, l'espèce est désignée étant comme "En voie de disparition".